Выбор сервиса для облачной геномики
Фармкомпаниям предложили выбрать между Google и Amazon
Софья Лопаева, Vademecum
Научно-исследовательские институты и фармкомпании должны будут выбрать между двумя «облачными» сервисами хранения данных о человеческом геноме – Google Genomics и Amazon Web Services. Amazon.com Inc и Google Inc поборются за хранение данных о геноме человека в «облаке». С помощью облачных технологий компании хотят помочь ученым в новых открытиях.
Объем мирового рынка «облачной геномики» составляет $100–300 млн и к 2018 году вырастет до $1 млрд. Предполагается, что победитель займет значительную долю этого рынка.
Эксперты предрекают успех подобным проектам, которые могут стать толчком к развитию персонализированного лечения на основе «генетического паспорта» пациента. Индивидуальный подход к терапии предполагает хранение огромного количества данных, на основе которых можно сделать вывод об эффективности лечения для определенных ДНК-профилей.
Как сообщает Reuters (Amazon, Google race to get your DNA into the cloud), помимо хранения данных ИТ-гиганты предлагают фармкомпаниям и исследовательским центрам «облачную» аналитику, которая позволит ученым разобраться в имеющихся данных о ДНК. Microsoft Corp и International Business Machines тоже хотят занять часть этого рынка.
Сейчас серверы Google и Amazon хранят информацию о геноме бесплатно. По сведениям некоторых аналитиков и ученых и заявлениям самих компаний, объем хранилища Amazon Web Services может быть больше.
У Amazon и Google уже есть крупные клиенты, пользующиеся сервисами «облачной геномики». Например, международное государственно-частное партнерство «1 000 геномов», занимающееся изучением генетической вариативности, пользуется базами Amazon и Google на безвозмездной основе. Regeneron Pharmaceuticals Inc и Geisinger Health Systems из Пенсильвании сотрудничают с Amazon, которая предоставила им хранилище для данных о геноме 250 тысяч человек. Amazon сотрудничает с благотворительной организацией Multiple Myeloma Foundation, которая занимается изучением множественной миеломы. Проект подразумевает получение полных последовательностей генома и прочих данных от тысячи пациентов для создания новых лекарств от этого заболевания. Amazon принимает участие в аналогичном проекте, посвященном болезни Альцгеймера, которым руководят Национальный институт изучения старения США (NIA) и Национальный научно-исследовательский институт генома человека (NHGRI).
Google, в свою очередь, выиграл грант фонда Autism Speaks на сбор и анализ геномов 10 тысяч детей-аутистов и их родителей, что позволит узнать генетические предпосылки развития этого заболевания. Другой клиент интернет-гиганта – компания Tute Genomics с базой, насчитывающей 8,5 млрд генетических вариаций.
Amazon берет за хранение одного полного генома человека $4-5 в месяц, а Google – $3-5. Компании также требуют плату за передачу данных и за вычисления, в случае если ученый хочет провести хранящиеся данные через аналитическое программное обеспечение. Инструмент анализа данных Redshift от Amazon обходится в 25 центов в час, или $1 тысяча за терабайт в год.
В середине мая 2015 года американский частный исследовательский медицинский центр и компания Крейга Вентера подписали соглашение о совместном секвенировании генома для поиска генов новых заболеваний. В конце марта 10 лидирующих фармацевтических и биотехнологических компаний решили сотрудничать в области расшифровки генома 100 тысяч тяжелобольных пациентов.
Портал «Вечная молодость» http://vechnayamolodost.ru
08.06.2015