Секвенирование ДНК: помедленнее, но точнее
Представлена усовершенствованная технология секвенирования ДНК
Дмитрий Сафин, «Компьюлента»
В последние годы секвенирование ДНК человека становится заметно доступнее; как известно, специалисты американской системы Национальных институтов здравоохранения поставили перед исследователями задачу скорейшего сокращения стоимости процедуры до тысячи долларов. Над созданием эффективных способов секвенирования трудятся сразу несколько научных групп.
Недавно свою оригинальную разработку представили физики из Университета Брауна (США). Ученые взяли за основу известную методику расшифровки нуклеотидной последовательности, которая предполагает считывание информации при пропускании молекул ДНК через миниатюрные отверстия в материале, и устранили ее главный недостаток, заключавшийся в том, что скорость прохождения пар оснований через отверстие была слишком высока (вследствие этого снижалась точность декодирования).
Для того чтобы замедлить процесс, исследователи «прикрепили» молекулу ДНК к частице оксида железа, воспользовавшись свойством биотина образовывать прочную связь со стрептавидином. Манипулируя параметрами электрического поля достаточно высокой напряженности, физики направили полученную связку в сторону отверстия в мембране; молекула свободно прошла насквозь, а частица диаметром 2,8 мкм «застряла» на противоположной стороне (диаметр поры составляет всего около 10 нм). Затем ученые с помощью магнитов заставили частицу двигаться в обратном направлении, контролируя таким образом скорость расшифровки.
По сообщению авторов, им удалось снизить среднюю скорость прохождения пар оснований через отверстие приблизительно в две тысячи раз. «Можно, впрочем, и еще замедлить, вплоть до полной остановки, – говорит Синьшэн Сэань Лин (Xinsheng Sean Ling), один из участников исследования. – Ведь скорость перемещения задается простым соотношением параметров электрического и магнитного полей». Ученые также отмечают то, что их методика позволяет одновременно обрабатывать несколько участков ДНК.
В ближайшем будущем исследователи планируют провести испытания новой технологии с использованием бактериальной ДНК.
Полная версия отчета ученых готовится к публикации в журнале Nanotechnology.
Подготовлено по материалам EurekAlert!.
Портал «Вечная молодость» www.vechnayamolodost.ru
17.04.2009